Μερικές από τις εκκλησίες που θα βρείτε στην Αλόννησο είναι οι παρακάτω.
Ι.Μ Κυρα-Παναγιά Αλοννήσου
Η Ιερά Μονή βρίσκεται στο νησάκι Κυρά-Παναγιά στο θαλάσσιο πάρκο Αλοννήσου 3,5ναυτικά μίλια βόρεια από την Αλόννησο και η σύνδεσή της γίνεται με πλοιάριο. Το μοναστήρι είναι αφιερωμένο στην Γέννηση της Θεοτόκου και είναι μετόχι της Ιεράς Μονής Μεγίστης Λαύρας.
Εκκλησία του Χριστού
Χτίστηκε το 17ο αιώνα και την βρίσκουμε ανεβαίνοντας προς την πλατεία της Χώρας, η μεγαλύτερη του Κάστρου. Έχει έντονα τα σημάδια της ενετικής επιρροής στην αρχιτεκτονική του και είναι μονόκλιτη βασιλική με τρούλο και πηλιορίτικες πλάκες. Αποτελεί σημείο συνάντισης των επισκεπτών στη Χωρα της Αλοννήσου.
Ναός Αγίου Γεωργίου
Λέγεται ότι χτίστηκε τον 16 αιώνα και ότι είναι η παλαιότερη εκκλησία που σώζεται μέχρι σήμερα στο νησί της Αλοννήσου. Βρίσκεται στη Χώρα στα στενά σοκάκια του Κάστρου.
Ναός Αγίου Νικολάου.
Βρίσκεται μέσα στα σοκάκια της Χώρας και θεωρείται ο κύριος ναός της. Στη θέση του ναού παλιότερα υπήρχαν οι ναοί του Αγίου Νικολάου και Αγίου Παντελεήμονα όπου και το 1964 κατεδαφίστηκαν από τους κατοίκους του νησιού.
Άγιοι Ανάργυροι.
Τελος, οι Αγιοι Αναργυροι βρίσκονται στη βόρεια πλευρά του νησιού στο οποίο θα φτάσετε έπειτα απο πεζοπορία στο μικρό μονοπάτι μέσα στο δάσος. Η παράδοση αναφέρει ότι οι ντόπιοι είχαν αρχικά επιλέξει άλλη θέση για να χτίσουν το μοναστήρι, όμως η εικόνα εμφανιζόταν στο σημείο εκείνο συνέχεια και ετσι αποφάσισαν να το χτίσουν εκεί. Αρχικά λειτούργησε ως μοναστικό κέντρο, έχουν βρεθεί ερείπια από κελιά και βοηθητικούς χώρους και σήμερα δίπλα από το εκκλησάκι έχει χτιστεί νέος ναός.
